第47章 生物界重构宏其大 文学界难避偏见门（第1页）
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在陈凯丽的点拨下，李宇轩的代码重构生物世界大业取得一系列的进展，先他定一个一个类，叫做生物类，给这个类定义了基本的一个属性：生存目标，默认值为两个，繁殖与存活，以及能量值属性。定义了几个方法：繁殖，死亡，遗传，演化，获取能量，设置了几个事件：当能量低于阈值时，当能量满足时，当环境适合繁殖时，当繁殖时，当繁殖成功时，当空闲时，当忙碌时。
从生物类六界系统分类下，向下定义和派生子类，定义出病毒界类、原核生物界类、真菌界类、原生生物界类、植物界类和动物界类，这些类继承了生物类的属性、方法和事件，并逐个进行重写和丰富各子类的内容。
病毒是颗粒很小、以纳米为测量单位、结构简单、寄生性严格、以复制进行繁殖的一类非细胞型微生物。病毒是比细菌还小、没有细胞结构、只能在活细胞中增殖的微生物。病毒由蛋白质和核酸组成。病毒界类的属性在继承生物父类的属性，具有繁殖和存活的目标属性，病毒本身没有细胞构造，其主要成分仅为核酸和蛋白质两种，故又称“分子生物”：每一种病毒只含一种核酸，不是dna就是Rna，病毒只能利用宿主的存活细胞内现成代谢系统合成自身的核酸和蛋白质成分，以核酸和蛋白质等“元件”的装配实现其大量繁殖；在离开宿主活细胞的条件下，有些病毒能以无生命的生物大分子状态存在，并长期保持其侵染活力。
dna和Rna是核酸的两种类型，dna是脱氧核糖核酸，Rna是核糖核酸。dna（脱氧核糖核酸）的基本组成部分是脱氧核苷酸。脱氧核苷酸是一类由嘌呤或嘧啶碱基、脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的小分子化合物，是构成生物体遗传物质dna的物质基础。脱氧核苷酸中四种碱基腺嘌呤（adenine，缩写为a）、胸腺嘧啶（thymine，缩写为t）、胞嘧啶（nete，缩写为nete，缩写为g）排列顺序的不同，决定了生物的多样性。Rna是核糖核酸的基本组成部分是核苷酸，核苷酸是一类由嘌呤碱或嘧啶碱、核糖或脱氧核糖以及磷酸三种物质组成的化合物。Rna由核糖核苷酸经磷酸二酯键缩合而成长链状分子。一个核糖核苷酸分子由磷酸，核糖和碱基构成。Rna的碱基主要有4种，即a（腺嘌呤）、g（鸟嘌呤）、c（胞嘧啶）、u（尿嘧啶），其中，u（尿嘧啶）取代了dna中的t（胸腺嘧啶）。
李宇轩严格按照陈凯丽提供的生物知识的结构，又单独定义了dna类、Rna类、以及碱基类和碱基类的子类，agcut。生物的遗传物质，正是通过这些碱基的不同排列组合传递的，如何组合传递如何的信息，已经不在李宇轩的研究范畴，他严谨的只是建立好了类的结构。李宇轩问过张凯丽，这些碱基是否都有明确的化学结构和分子式，张凯丽只要是存在的，一定有明确的化学结构和分子式，而其自身的组合，就无穷无尽了，无论组合，都只是碳、氢、氧、氮四个元素的组合。
李宇轩惊讶的感叹道："那岂不是可以人造这些dna、Rna，在通过他们的组合存放下我这个类定义的代码。代码重构生物，生物记录代码。"
张凯丽打趣道："理论上是可以的，弄好了，你就是造世主了，到时候把我造的更漂亮点，我就不来辛苦读这个博士了，靠扭扭腰吃饭，活的俗不可耐一点。"
定义原核生物界类的时候，李宇轩同时定义了细胞类。原核生物是一种单细胞生物，缺乏细胞核和其他膜结合细胞器。在生物分类的三域系统中，基于分子分析，原核生物分为两个域：细菌（原真细菌）和古细菌（原古细菌）。具有细胞核的生物体位于第三个领域，即真核生物。
在生命起源的研究中，原核生物被认为出现在真核生物之前。原核生物的繁殖方式为细胞分裂繁殖。原核生物单细胞会以简单二分裂方式繁殖，无有丝分裂或减数分裂，没有性行为，有的种类有时有通过接合、转化或转导，将部分基因组从一个细胞传递到另一个细胞的准性行为。
在定义细胞类的时候，根据系统的定义，细胞是一切生物体形态结构和生理功能的基本单位，均由细胞膜、细胞质与细胞核三部分组成，细胞膜：由膜脂、膜蛋白及膜糖类组成，是包裹于细胞表面、将细胞与周围微环境隔离的界膜，构成特殊屏障，在细胞的生命活动中起着重要作用；细胞质：又称胞浆，是由细胞质基质、细胞器和包涵物组成；细胞核：由核被膜、染色质、核仁与核基质四部分组成。细胞核含有dna遗传信息，通过dna的复制与转录，细胞核成为细胞增殖、分化代谢等功能活动的重要结构。细胞核中也有Rna，不过大部分Rna在细胞质内，在Rna聚合酶的作用下，dna可根据模板合成互补的Rna链，这个Rna被称为信使核糖核酸，主要在细胞核内合成。
李宇轩在细胞类的定义中中，按照结构，细胞膜、细胞质、细胞核被分别定义为新的数据类，并且又以细胞类的属性存在，而细胞核属性中的dna属性，又只能赋予dna类的实例。
细胞是组成真菌、原生生物、植物和动物的基本组成部分。在整个生物界，除了病毒，其他的生物都是由细胞所构成，而原核生物就是一个原始的细胞，而病毒，恰恰是组成任意细胞核或者细胞质中的dna或者Rna的一个片段，细胞却并非一定由某些片段组成，但这些病毒作为这些片段要靠侵入细胞而生存，继而执行演变、繁殖或者死亡的方法。
真菌界均属真核生物，真菌广泛分布于全球各带的土壤、水体、动植物及其残骸和空气中，营腐生、寄生和共生生活。真菌界是指营养方式为异养的真核菌类。分为真菌门和粘菌门，真菌界细胞无质体，不含叶绿素，不能进行光合作用，其营养方式不是自养而是异养，能分解和吸收有机物质，腐生或寄生，细胞壁的化学组成除少数为纤维素外，大多由几丁质构成。而粘菌更为特殊，生活史中有动物性阶段和植物性阶段，动物性阶段的有机体无壁，仅为一团裸露的原生质，而且可作变形运动，吞食细菌和有机物颗粒;在植物性阶段则形成孢子囊，产生具纤维素壁的孢子。少数真菌为单细胞，大部分真菌为多细胞结构，而细菌则是真菌界的单细胞生物。真菌是一大类具有细胞壁和典型细胞核，不含叶绿素，不分根、茎、叶的微生物。
真菌的繁殖方式包括无性生殖、有性生殖和准性生殖。无性生殖是指不经过两性细胞的结合便产生新的个体。有性生殖有游动配子配合、配子囊接触交配、配子囊交配、性孢子配合和体细胞配合等形式。有的真菌在质配后立即进行核配。重新使染色体的数目减为单倍。有性繁殖方式因菌种不同而异。对多数真菌来说，由菌丝分化形成特殊的性胞（器官）配子囊或由配子囊产生的配子来相互交配，形成有性孢子，两个有性细胞结合以后产生新个体。
根据产生有性孢子菌丝来源或亲和力不同，一般可分为同宗配合和异宗配合两类。同宗配合是指不同交配型的核在一个菌丝体中，即每一菌体都是自身可孕的，不靠别的菌体帮助而能独立地进行有性生殖。异宗配合是是指每一菌体都是自身不孕的，不管它是否雌雄同体，都需要借助另一个可亲和菌体的不同交配型来进行有性生殖，以“+”和“-”来表示两个不同质的细胞。
那日沉浸于真菌类篇章研读的少闹钟李宇轩无法自拔，又在陈凯丽的宿舍里和她刚进行完毕一场精彩的性探讨，事毕刚心生贤者时刻的空洞感，又旋即想到这有性繁殖居然从真菌就开始了，顿时全然索然无味："凯丽，你说这真菌都干的事，咱两个人咱干的还那么津津有味呢？"
张凯丽看着李宇轩，噗嗤笑了出来，拿出身边的一本《真菌繁殖》教科书，翻了翻找到一页，念了起来："现真菌存在性分化现象。大多数真菌是雌、雄同株的，即同一个菌体上可以分化出雌、雄配子体，少数为雌雄异株的，即一些菌株只产生雌配子体而另一些菌株只产生雄配子体。然而并不是所有雌雄同株的真菌都可以单株进行有性生殖。雌、雄配子体可以交配完成有性生殖的称为性亲和（sexua1patib1e），不能交配的称为性不亲和（sexua1inpatib1e）。有些真菌单个菌株就可以完成有性生殖称为同宗配合（homotha11ism），而多数真菌为异宗配合（heterotha11ism）的．即单个菌株不能完成有性生殖，需要两个性亲和菌株共同生长在一起才能完成有性生殖。多数真菌如鞭毛菌、接合菌、子囊菌及少数担子菌的异宗配合特性一般由一对等位基因（通常用a、a表示）控制，因此可以分为两种交配型，即“+”菌株和“-”菌株。“+”菌株必须与“-”菌株交配才能完成有性生殖，分别单独培养不能进行有性生殖。许多高等担子菌的性的亲和性分化更为复杂，由多个等位基因控制。可以分为四种交配型。同宗配合或异宗配合是真菌的一种生理特征，在分类上意义不大。相近的真菌如同一个属的不同种或同一个种的不同菌株，可以是同宗配合，也可以是异宗配合。对大多数雌、雄同株的异常配合真菌，同一种类的不同交配型菌株之间，除交配型的生理特征外，在形态上没有明显区别。一般来说．同宗和异宗配合现象在卵菌、接合菌、子囊菌中都常见，而担子菌则异宗配合的居多。异宗配合真菌的有性生殖需要不同菌株间的杂交，因此有性后代比同宗配合真菌具有更大的变异性、这对增强异宗配合真菌适应性与生活能力是有益的。
听懂了么？"
李宇轩仔细的听，认真的答："一部分。"
张凯丽："我告诉你，这有性生殖，两两交配，是为了通过杂交变异，变异是为了适应性和提高生活能力。咱两个刚才交配，是为了生殖么？"
李宇轩："不是。"
张凯丽："那是为了什么？"
李宇轩："为了，爽？"
张凯丽："爽么？"
李宇轩："爽！"
张凯丽："真菌会爽么？"
李宇轩："我不知道。爽它也不会说。"
论文《用面向对象的编程语言创建世界生物模型》写到真菌类时，篇幅已经巨大，李宇轩增长了很多生物学的知识，但是基于非专业，不敢展开深入，只将类的框架按照生物的分类逻辑、行为逻辑、继承逻辑严谨的做好骨架，定义好属性、方法和事件。他也更深刻的感到，这个论文如果写成，张凯丽功不可没，如果没有张凯丽，他也无法独立完成。李宇轩是个学术认真的人，自始至终不让张凯丽直接参与任何论文的指正，完全独立完成，因此就更少不了隔三差五的去找张凯丽讨教知识、咨询参考资料和顺便两个人一起探讨人生和高等生物的快乐。而李宇轩，也迫不及待的将论文的节奏推进到植物界和动物界的领域。
相比清华大学的学习生活，远在大不列颠帝国的江灵的生活则更是多元，江灵的老师之一是牛津大学着名的英国国宝级教授作家k。s。s托尔银，作为语言学家，他的《魔杖》七部曲，在书中创造了复杂而丰富的从基督诞生到中土世界，并构建了独一无二的语言体系。他的作品以其深邃的哲学意义和浩瀚的想象力而着称，深刻地影响了后来的奇幻文学作家，并被6续拍成了诸多电影作品和制作成了游戏作品，电影作品部部包揽当年的奥斯卡各类奖项，游戏作品也长期处于西方价值观主导世界的游戏榜。世界文学界流行一种说法，"东方出金庸，射雕屠龙笑傲八部；西方托尔银，甘道霍比魔杖天使。"
k。s。s托尔银每个月会有一次现代文学的论坛课，江灵都一定会参加，与世界文豪进行面对面思想碰撞是一件受益匪浅的事情。这一天，教室里挤满了6o个同学，分十组各自围着桌子在教室里扇形排开，托尔银教授坐在讲台前的沙上，与各位同学们聊天，今天的议题是"中世界欧洲文化的优越性"，今天的课程方式是自由论坛模式，以托尔银教授的讲述和同学们的互动相辅相成的模式进行。
托尔银："中世纪是从公元476年西罗马帝国被条顿族领奥多阿克所灭亡开始，到15世纪之间的九百多年。中世纪文化是以基督教文化为主导意识形态因素的综合文化，三种主要文化在基督教前提之下相互融合。同学们是否知道是哪三种文化？"
江灵："古希腊罗马文化、希伯莱文化和北欧民族哥特文化。"
托尔银："很好，这位中国女同学。从这八百年文化演进的阶段性特征上看，又可以分作两个时期：一是北欧进入西罗马造成的“黑暗时代”；二、加洛林王朝的文艺复兴时期。中世纪是从粗野的原始状态展而来的，基督教在文化、教育、哲学、文艺乃至整个精神领域里，占有绝对的统治地位，成了欧洲封建制度的精神支柱。同时期，世界各地都十分的愚昧落后。宗教成为了人们精神生活的绝大部分，宗教教义就是政治信条，教会垄断了文化教育。
中世纪的欧洲封建社会实行的是典型的等级制度，而骑士制度就是这些等级制度的表现之一。骑士阶级在历史的展演进的过程中，实际上是形成了自己的一套道德标准和人生信条。骑士精神直到今天也依然是欧洲文化精神的旗帜。而同时期的中国处于从魏晋乱世到隋唐乱世的1ooo年中，印度也正在经受来自大夏希腊人、塞人、安息人、中亚白匈奴、穆斯林帝国的侵略，信仰崩塌，这两个文明此时文化落后、百姓愚昧，被强大的暴力统治压制在奴隶一样生活的最底线。"
此刻江灵旁边的中国同学徐港瀚小声和江灵嘀咕，"这从南北朝到明朝，唐宋元明的盛世，全被五胡十六国和五代十国给替代了？"。一个印度同学此刻站起来，对印度在欧洲中世纪同期处于愚昧落后和信仰崩塌的说法提出质疑，他的观点是："孔雀王朝造就了伟大的文明。"叽里呱啦带着咖喱味的英语说了半天，不用托儿银教授开口，班上欧洲各国同学以严谨的傲慢态度给他怼了回去，班上另外四个印度同学纷纷加入了辩论，一时间两拨人你三言我两语怼的不可开交，不相上下。
托尔银教授打个原唱，下结论式的说："欧洲的文化更容易产生社会的多元宽容，有利于创新。注重精确性，注重公理化。注重契约，对宗教虔诚，注重独立奋斗。"
徐港瀚此刻正要站起来就中国的问题辩论几句，江灵拉了拉徐港瀚，轻声说道："傲慢与偏见，不予辩论！"
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